KIOS und FIDS
Die heute bekanntesten muslimischen Dachorganisationen in der Schweiz sind die Koordination Islamischer Organisationen Schweiz (KIOS) und die Föderation Islamischer Dachorganisationen in der Schweiz (FIDS). Beide sind Mitglied im Schweizerischen Rat der Religionen und Gesprächspartner der eidgenössichen Behörden.

Die 2000 in Bern gegründete KIOS wird vom iranischen Entwicklungssoziologen Farhad Afshar geleitet. In ihr sind drei Kantonalverbände sowie etwa 10 weitere Vereine zusammengeschlossen, unter anderen die 1989 in Zürich gegründete Gemeinschaft islamischer Organisationen der Schweiz.

Die FIDS wurde 2006 gegründet, ihr Präsident ist der aus Palästina stammende Arzt Hisham Maizar. Sie besteht nach eigenen Angaben aus 13 Dachorganisationen und vertritt über 170 islamische Zentren. Sie dürfte die grösste und aktivste islamische Organisation in der Schweiz sein. Sie will nach eigenen Angaben unter anderem die Integration der Muslime in der Schweiz fördern.

Liga der Muslime
Die Liga der Muslime in der Schweiz wurde 1994 von Tariq Ramadan gegründet und ist vor allem in der West- und Südschweiz aktiv. Sie ruft ihre Mitglieder auf, sich aktiv zu integrieren, anstatt sich aus dem öffentlichen Leben zurückzuziehen. Auch die Idee einer islamischen Partei kam aus ihren Reihen.

Forum für einen fortschrittlichen Islam
Das 2004 gegründete und von der Tunesien-Schweizerin Saida Keller-Messahli präsidierte Forum für einen fortschrittlichen Islam zählt rund 250 Mitglieder. Es vertritt einen offenen Islam, einschliesslich der Selbstbestimmung der Frau.

Islamischer Zentralrat
Vor dem Hintergrund der Debatte um die Minarett-Initiative wurde im Hebst 2009 in Bern der Islamische Zentralrat Schweiz (IZRS) gegründet, der vom Bieler Konvertiten Nicolas Blancho präsidiert wird. Der IZRS gilt als fundamentalistisch. Nach eigenen Angaben gehören ihm rund 1000 Personen an, vielfach Schweizer Konvertiten.

Weitere Organisationen
Als weitere wichtige Organisationen werden u.a. die 1978 von türkischen Emigranten gegründete Föderation Islamischer Vereine (Gemeinschaften) der Schweiz erwähnt, ferner die Schweizerische Islamische Glaubensgemeinschaft, die unter anderem die Hadsch (Mekka-Pilgerfahr) organisiert, sowie die Organisation Muslime und Musliminnen der Schweiz, die die Website islam.ch betreibt.

Starke regionale Verbände sind die Vereinigung der Islamischen Organisationen in Zürich (VIOZ) und die Vereinigung der Islamischen Organisationen in Genf (UOMG). (cdm, sda)